А сжатие HTML в Clearfy не включал. У меня для для этого стоит Fastest Cache, хотя сейчас он тоже отключен. Вчера ставил в то же место другой скрипт, тот отображается без ошибок. Так что вырезаются именно скрипты счетчиков. В Яндекс Метрике есть кусок HTML кода, так он так же остаётся видимым...